Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD3Q15059 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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