Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAPHQ15003 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPHQ15003 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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