Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM25Q14258 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM25Q14258 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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