Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKEQ14164 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKEQ14164 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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