Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIDRQ14159 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPIDRQ14159 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
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