Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA1SQ13698 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CACNA1SQ13698 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
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