Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPBGQ13641 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TPBGQ13641 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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TPBGQ13641 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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TPBGQ13641 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPBGQ13641 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPBGQ13641 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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