Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PKD2Q13563 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PKD2Q13563 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PKD2Q13563 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
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