Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGB3BPQ13352 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3BPQ13352 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3BPQ13352 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
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