Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.712e-66■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.182e-66■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.722e-66■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.582e-66■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 SSBP3-201ENST00000326956 2913 ntTSL 215.88■□□□□ 0.132e-66■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 SSBP3-215ENST00000533946 431 ntTSL 311.54□□□□□ -0.562e-66■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 SSBP3-212ENST00000528930 862 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.772e-66■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.792e-9■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 ADNP2-205ENST00000561195 124 ntTSL 37.81□□□□□ -1.162e-9■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 PLIN3-205ENST00000589163 1699 ntTSL 316.86■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 36.3
PABPC4Q13310 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 15e-14■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 ERCC3-202ENST00000426778 2916 ntTSL 215.83■□□□□ 0.128e-8■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 ERCC3-203ENST00000445889 2920 ntTSL 215.59■□□□□ 0.098e-8■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 ERCC3-201ENST00000285398 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.638e-8■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 ERCC3-208ENST00000491292 4018 ntTSL 210.7□□□□□ -0.78e-8■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.729e-8■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 FAM129A-202ENST00000417056 602 ntTSL 33.91□□□□□ -1.789e-8■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.33e-7■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 NSUN5-206ENST00000471461 2286 ntTSL 219■□□□□ 0.633e-7■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 36.2
PABPC4Q13310 MDH2-207ENST00000490105 569 ntTSL 327.42■■□□□ 1.981e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 LBH-208ENST00000467242 1689 ntTSL 226.89■■□□□ 1.891e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 AKT1-217ENST00000557494 408 ntTSL 226.52■■□□□ 1.841e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TARBP2-212ENST00000549610 1116 ntTSL 1 (best)22.54■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TARBP2-205ENST00000546889 1063 ntTSL 221.26■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TARBP2-207ENST00000547388 576 ntTSL 419.66■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 CDHR5-207ENST00000531177 2816 ntTSL 218.81■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 ZNF687-202ENST00000336715 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)17.82■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TARBP2-210ENST00000549028 557 ntTSL 417.5■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TARBP2-217ENST00000551741 992 ntTSL 217.06■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TARBP2-218ENST00000552650 954 ntTSL 216.3■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TARBP2-206ENST00000547064 759 ntTSL 314.66□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 STK26-203ENST00000394335 3017 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 ZNF687-203ENST00000426871 3277 ntTSL 213.68□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 ZNF687-206ENST00000449313 4185 ntTSL 513.22□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TARBP2-219ENST00000552817 668 ntTSL 312.88□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 STK26-201ENST00000354719 3179 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 MDH2-206ENST00000461665 551 ntTSL 27.81□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 NME3-203ENST00000563367 891 ntTSL 333.86■■■■□ 3.012e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.532e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 NME3-208ENST00000565379 911 ntTSL 230.51■■■□□ 2.472e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.122e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.112e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TMEM9-211ENST00000497582 1075 ntTSL 327.38■■□□□ 1.975e-23■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.672e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TBCB-208ENST00000588385 776 ntTSL 1 (best)24.03■■□□□ 1.442e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.412e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.42e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.392e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.072e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TBCB-203ENST00000468156 630 ntTSL 221.6■■□□□ 1.052e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.972e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.81e-15■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TBCB-206ENST00000585910 656 ntTSL 219.68■□□□□ 0.742e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 POP4-211ENST00000591824 846 ntTSL 519.59■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EIF2B4-202ENST00000405940 1570 ntTSL 1 (best)19.43■□□□□ 0.72e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.532e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 PC-206ENST00000528224 1008 ntTSL 217.93■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.41e-15■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 517.21■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 MINK1-204ENST00000571207 4569 ntTSL 516.12■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 NRSN2-207ENST00000608875 941 ntTSL 315.67■□□□□ 0.11e-15■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.091e-15■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 ZNF274-206ENST00000595146 4852 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 POP4-210ENST00000591061 502 ntTSL 415.29■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 02e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-15■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EIF2B4-209ENST00000478311 607 ntTSL 214.36□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 36.1
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 352.5 ms