Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHAF1AQ13111 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHAF1AQ13111 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHAF1AQ13111 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
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