Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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