Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXI1Q12951 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXI1Q12951 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXI1Q12951 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXI1Q12951 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXI1Q12951 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI1Q12951 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.7 ms