Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF2Q12947 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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