Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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