Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN2Q12907 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMAN2Q12907 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN2Q12907 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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