Protein–RNA interactions for Protein: Q12899

TRIM26, Tripartite motif-containing protein 26, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM26Q12899 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM26Q12899 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM26Q12899 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM26Q12899 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM26Q12899 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM26Q12899 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM26Q12899 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM26Q12899 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM26Q12899 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM26Q12899 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
TRIM26Q12899 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRIM26Q12899 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM26Q12899 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM26Q12899 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms