Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
APOBRQ0VD83 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOBRQ0VD83 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOBRQ0VD83 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOBRQ0VD83 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms