Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFFO1Q0D2I5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms