Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF543Q08ER8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF543Q08ER8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms