Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP3CAQ08209 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP3CAQ08209 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms