Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms