Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4BQ07343 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4BQ07343 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4BQ07343 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4BQ07343 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4BQ07343 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4BQ07343 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PDE4BQ07343 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE4BQ07343 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms