Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKAP4Q07065 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms