Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 JUP-208ENST00000449889 1069 ntTSL 322.19■■□□□ 1.145e-8■■■■■ 30.5
FMR1Q06787 ANK1-214ENST00000524227 3825 ntTSL 1 (best)9.9□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 30.5
FMR1Q06787 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 30.5
FMR1Q06787 DDB1-216ENST00000539739 1624 ntTSL 518.27■□□□□ 0.518e-8■■■■■ 30.5
FMR1Q06787 SPTBN1-203ENST00000389980 2164 ntTSL 1 (best)13.85□□□□□ -0.198e-7■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 TRAPPC10-203ENST00000422875 5267 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 RUNX1-204ENST00000399237 822 ntTSL 527.17■■□□□ 1.944e-16■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.258e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 RUNX1-208ENST00000455571 610 ntTSL 322.66■■□□□ 1.224e-16■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-213ENST00000471793 1779 ntTSL 222.53■■□□□ 1.28e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.734e-16■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.668e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.038e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 RUNX1-214ENST00000475045 1582 ntTSL 515.12■□□□□ 0.014e-16■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.048e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.118e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.148e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.178e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.178e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 GLE1-202ENST00000372770 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.394e-16■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.418e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 GLE1-201ENST00000309971 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-16■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 IKZF1-208ENST00000426121 201 ntTSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.058e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 HMGXB3-203ENST00000510472 580 ntTSL 214.59□□□□□ -0.076e-8■■■■■ 30.4
FMR1Q06787 TNKS-210ENST00000519930 357 ntTSL 1 (best)5□□□□□ -1.618e-15■■■■■ 30.3
FMR1Q06787 PRRC2A-211ENST00000484787 756 ntTSL 216.83■□□□□ 0.281e-13■■■■■ 30.3
FMR1Q06787 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 30.2
FMR1Q06787 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.48e-7■■■■■ 30.2
FMR1Q06787 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 420.41■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 30.2
FMR1Q06787 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.285e-15■■■■■ 30.2
FMR1Q06787 SOGA1-204ENST00000465671 4478 ntTSL 214.18□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 30.2
FMR1Q06787 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 30.2
FMR1Q06787 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 30.2
FMR1Q06787 KLHDC10-202ENST00000463413 503 ntTSL 232.1■■■□□ 2.734e-7■■■■■ 30.2
FMR1Q06787 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 30.2
FMR1Q06787 KLHDC10-203ENST00000468226 772 ntTSL 38.88□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 30.2
FMR1Q06787 TRAPPC10-205ENST00000461889 563 ntTSL 210.1□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 30.1
FMR1Q06787 TRAPPC10-209ENST00000481460 455 ntTSL 27.59□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 30.1
FMR1Q06787 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 419.1■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 30.1
FMR1Q06787 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.285e-15■■■■■ 30.1
FMR1Q06787 DIAPH1-212ENST00000518484 546 ntTSL 49.2□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 30
FMR1Q06787 GNL2-201ENST00000373062 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.867e-7■■■■■ 30
FMR1Q06787 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 215.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 30
FMR1Q06787 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.025e-15■■■■■ 30
FMR1Q06787 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 513.54□□□□□ -0.245e-15■■■■■ 30
FMR1Q06787 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.335e-15■■■■■ 30
FMR1Q06787 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.425e-15■■■■■ 30
FMR1Q06787 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.455e-15■■■■■ 30
FMR1Q06787 TBC1D20-203ENST00000461304 2024 ntTSL 1 (best)25.31■■□□□ 1.643e-10■■■■■ 30
FMR1Q06787 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.63e-10■■■■■ 30
FMR1Q06787 TBC1D20-204ENST00000494633 3820 ntTSL 215.41■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 30
FMR1Q06787 TBC1D20-202ENST00000461188 5195 ntTSL 29.94□□□□□ -0.823e-10■■■■■ 30
FMR1Q06787 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 30
FMR1Q06787 TRIP12-210ENST00000453485 652 ntTSL 313.73□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 30
FMR1Q06787 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 30
FMR1Q06787 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 210.38□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.028e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.088e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.188e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.198e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.38e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 ARID1A-210ENST00000636072 1128 ntTSL 517.99■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 ARID1A-214ENST00000636794 1068 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 VARS-220ENST00000461874 845 ntTSL 524.14■■□□□ 1.451e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 CCND3-210ENST00000506555 308 ntTSL 315.95■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 NFE2L1-219ENST00000584137 529 ntTSL 429.44■■■□□ 2.32e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.152e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 RHOF-207ENST00000546227 1219 ntTSL 528.26■■■□□ 2.112e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.962e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 CLUH-207ENST00000573641 581 ntTSL 325.45■■□□□ 1.662e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.512e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.222e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.022e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)21.06■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 RHOF-206ENST00000545544 826 ntTSL 520.57■□□□□ 0.882e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 RHOF-205ENST00000541657 1626 ntTSL 520.5■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SIK3-211ENST00000485363 764 ntTSL 1 (best)20.21■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 NFE2L1-221ENST00000585062 556 ntTSL 420.19■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SNX1-203ENST00000558040 774 ntTSL 519.52■□□□□ 0.728e-16■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 NCOR2-210ENST00000440337 956 ntTSL 318.83■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 NCOR2-211ENST00000443451 951 ntTSL 518.51■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 NCOR2-206ENST00000418829 563 ntTSL 317.98■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SEC14L1-206ENST00000561633 603 ntTSL 1 (best)17.84■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SEC14L1-207ENST00000561721 637 ntTSL 216.99■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SEC14L1-209ENST00000564509 806 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 MYH9-211ENST00000495928 329 ntTSL 215.69■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.038e-16■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SEC14L1-211ENST00000569632 377 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -02e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.018e-16■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SEC14L1-224ENST00000589827 1791 ntTSL 214.73□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)14.6□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SIK3-204ENST00000445177 6331 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.47□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 29.9
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 68.5 ms