Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHR1Q03591 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHR1Q03591 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms