Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPCQ03188 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms