Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MUC3AQ02505 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MUC3AQ02505 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms