Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP4Q02446 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP4Q02446 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP4Q02446 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SP4Q02446 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP4Q02446 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP4Q02446 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP4Q02446 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP4Q02446 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP4Q02446 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP4Q02446 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP4Q02446 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SP4Q02446 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP4Q02446 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP4Q02446 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP4Q02446 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP4Q02446 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP4Q02446 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP4Q02446 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP4Q02446 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP4Q02446 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP4Q02446 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP4Q02446 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP4Q02446 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP4Q02446 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SP4Q02446 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SP4Q02446 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SP4Q02446 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP4Q02446 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP4Q02446 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP4Q02446 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP4Q02446 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP4Q02446 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP4Q02446 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP4Q02446 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP4Q02446 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP4Q02446 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP4Q02446 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP4Q02446 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP4Q02446 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP4Q02446 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP4Q02446 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP4Q02446 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP4Q02446 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP4Q02446 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP4Q02446 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP4Q02446 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP4Q02446 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP4Q02446 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP4Q02446 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP4Q02446 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP4Q02446 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP4Q02446 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP4Q02446 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP4Q02446 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP4Q02446 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP4Q02446 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP4Q02446 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SP4Q02446 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SP4Q02446 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP4Q02446 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP4Q02446 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP4Q02446 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP4Q02446 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP4Q02446 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP4Q02446 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP4Q02446 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP4Q02446 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP4Q02446 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP4Q02446 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP4Q02446 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP4Q02446 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP4Q02446 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP4Q02446 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP4Q02446 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP4Q02446 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP4Q02446 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP4Q02446 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP4Q02446 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP4Q02446 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP4Q02446 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP4Q02446 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP4Q02446 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP4Q02446 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP4Q02446 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP4Q02446 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP4Q02446 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms