Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB3Q01970 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLCB3Q01970 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms