Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK17Q00537 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms