Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX1P83916 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX1P83916 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX1P83916 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX1P83916 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX1P83916 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX1P83916 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX1P83916 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX1P83916 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX1P83916 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX1P83916 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX1P83916 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX1P83916 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX1P83916 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX1P83916 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX1P83916 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX1P83916 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX1P83916 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX1P83916 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX1P83916 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX1P83916 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX1P83916 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX1P83916 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX1P83916 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX1P83916 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX1P83916 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX1P83916 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX1P83916 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX1P83916 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX1P83916 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX1P83916 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX1P83916 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX1P83916 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX1P83916 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX1P83916 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX1P83916 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX1P83916 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX1P83916 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX1P83916 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX1P83916 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX1P83916 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX1P83916 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX1P83916 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX1P83916 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX1P83916 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX1P83916 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CBX1P83916 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX1P83916 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX1P83916 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX1P83916 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX1P83916 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX1P83916 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX1P83916 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX1P83916 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX1P83916 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX1P83916 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX1P83916 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX1P83916 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX1P83916 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX1P83916 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX1P83916 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX1P83916 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX1P83916 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX1P83916 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX1P83916 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX1P83916 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX1P83916 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX1P83916 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX1P83916 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX1P83916 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX1P83916 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX1P83916 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX1P83916 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX1P83916 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX1P83916 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX1P83916 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX1P83916 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX1P83916 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX1P83916 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX1P83916 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX1P83916 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX1P83916 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX1P83916 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX1P83916 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX1P83916 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX1P83916 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX1P83916 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms