Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX1P78414 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX1P78414 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX1P78414 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX1P78414 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX1P78414 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX1P78414 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX1P78414 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX1P78414 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX1P78414 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX1P78414 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX1P78414 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX1P78414 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX1P78414 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX1P78414 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX1P78414 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRX1P78414 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX1P78414 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX1P78414 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX1P78414 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX1P78414 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX1P78414 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRX1P78414 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX1P78414 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX1P78414 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX1P78414 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX1P78414 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX1P78414 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX1P78414 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX1P78414 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX1P78414 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX1P78414 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX1P78414 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX1P78414 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX1P78414 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX1P78414 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX1P78414 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX1P78414 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX1P78414 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX1P78414 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX1P78414 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX1P78414 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX1P78414 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX1P78414 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX1P78414 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX1P78414 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX1P78414 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX1P78414 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX1P78414 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX1P78414 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX1P78414 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX1P78414 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX1P78414 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX1P78414 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX1P78414 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX1P78414 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX1P78414 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX1P78414 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX1P78414 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX1P78414 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX1P78414 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX1P78414 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX1P78414 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX1P78414 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX1P78414 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX1P78414 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX1P78414 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX1P78414 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX1P78414 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX1P78414 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX1P78414 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX1P78414 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX1P78414 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX1P78414 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms