Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRAMEP78395 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms