Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT85P78386 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT85P78386 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT85P78386 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT85P78386 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT85P78386 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT85P78386 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT85P78386 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT85P78386 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT85P78386 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT85P78386 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT85P78386 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT85P78386 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT85P78386 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT85P78386 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT85P78386 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT85P78386 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT85P78386 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT85P78386 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT85P78386 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT85P78386 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT85P78386 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT85P78386 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT85P78386 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT85P78386 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT85P78386 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT85P78386 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT85P78386 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT85P78386 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT85P78386 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT85P78386 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT85P78386 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT85P78386 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT85P78386 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT85P78386 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT85P78386 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT85P78386 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT85P78386 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT85P78386 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT85P78386 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT85P78386 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT85P78386 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT85P78386 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT85P78386 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT85P78386 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT85P78386 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT85P78386 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT85P78386 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT85P78386 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT85P78386 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT85P78386 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT85P78386 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT85P78386 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT85P78386 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT85P78386 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT85P78386 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT85P78386 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT85P78386 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT85P78386 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT85P78386 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT85P78386 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT85P78386 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT85P78386 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT85P78386 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT85P78386 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT85P78386 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT85P78386 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT85P78386 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT85P78386 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT85P78386 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT85P78386 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT85P78386 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT85P78386 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT85P78386 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT85P78386 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT85P78386 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT85P78386 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT85P78386 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT85P78386 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT85P78386 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT85P78386 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT85P78386 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT85P78386 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT85P78386 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT85P78386 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT85P78386 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT85P78386 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT85P78386 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms