Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1CAP62136 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1CAP62136 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms