Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVK-21P61565 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms