Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTENP60484 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTENP60484 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTENP60484 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTENP60484 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTENP60484 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTENP60484 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTENP60484 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTENP60484 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTENP60484 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTENP60484 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTENP60484 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTENP60484 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTENP60484 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTENP60484 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTENP60484 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTENP60484 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTENP60484 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTENP60484 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTENP60484 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTENP60484 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTENP60484 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTENP60484 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTENP60484 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTENP60484 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTENP60484 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTENP60484 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTENP60484 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTENP60484 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTENP60484 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTENP60484 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTENP60484 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTENP60484 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTENP60484 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTENP60484 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTENP60484 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTENP60484 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTENP60484 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTENP60484 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTENP60484 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTENP60484 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTENP60484 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTENP60484 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTENP60484 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTENP60484 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTENP60484 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTENP60484 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTENP60484 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTENP60484 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTENP60484 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTENP60484 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTENP60484 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTENP60484 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTENP60484 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTENP60484 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTENP60484 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTENP60484 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTENP60484 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTENP60484 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTENP60484 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTENP60484 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTENP60484 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTENP60484 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTENP60484 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTENP60484 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTENP60484 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTENP60484 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTENP60484 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTENP60484 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTENP60484 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTENP60484 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTENP60484 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTENP60484 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTENP60484 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTENP60484 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTENP60484 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTENP60484 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTENP60484 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTENP60484 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTENP60484 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTENP60484 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTENP60484 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTENP60484 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTENP60484 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTENP60484 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTENP60484 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTENP60484 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms