Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCDC1P59894 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCDC1P59894 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms