Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMDP57764 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMDP57764 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms