Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME5P56597 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME5P56597 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME5P56597 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME5P56597 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME5P56597 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME5P56597 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME5P56597 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME5P56597 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME5P56597 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME5P56597 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME5P56597 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME5P56597 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME5P56597 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME5P56597 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME5P56597 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME5P56597 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NME5P56597 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME5P56597 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME5P56597 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NME5P56597 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME5P56597 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME5P56597 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME5P56597 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME5P56597 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME5P56597 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME5P56597 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME5P56597 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME5P56597 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME5P56597 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME5P56597 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME5P56597 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME5P56597 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME5P56597 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME5P56597 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME5P56597 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME5P56597 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME5P56597 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME5P56597 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME5P56597 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME5P56597 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME5P56597 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME5P56597 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME5P56597 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME5P56597 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME5P56597 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME5P56597 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME5P56597 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME5P56597 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME5P56597 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME5P56597 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME5P56597 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME5P56597 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME5P56597 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME5P56597 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME5P56597 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME5P56597 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME5P56597 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME5P56597 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME5P56597 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME5P56597 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NME5P56597 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME5P56597 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME5P56597 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME5P56597 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME5P56597 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME5P56597 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME5P56597 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME5P56597 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME5P56597 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME5P56597 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME5P56597 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME5P56597 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME5P56597 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME5P56597 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME5P56597 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME5P56597 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NME5P56597 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME5P56597 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME5P56597 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME5P56597 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME5P56597 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME5P56597 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME5P56597 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME5P56597 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME5P56597 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME5P56597 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME5P56597 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms