Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3BP55884 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3BP55884 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms