Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH13P55290 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH13P55290 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH13P55290 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH13P55290 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH13P55290 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH13P55290 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH13P55290 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH13P55290 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH13P55290 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH13P55290 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH13P55290 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH13P55290 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH13P55290 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH13P55290 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH13P55290 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH13P55290 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH13P55290 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH13P55290 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH13P55290 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH13P55290 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH13P55290 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH13P55290 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH13P55290 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH13P55290 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH13P55290 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH13P55290 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH13P55290 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH13P55290 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH13P55290 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH13P55290 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH13P55290 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH13P55290 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH13P55290 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH13P55290 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH13P55290 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH13P55290 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH13P55290 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH13P55290 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH13P55290 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH13P55290 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH13P55290 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH13P55290 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH13P55290 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH13P55290 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH13P55290 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH13P55290 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH13P55290 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH13P55290 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH13P55290 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH13P55290 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH13P55290 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH13P55290 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH13P55290 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH13P55290 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH13P55290 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH13P55290 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH13P55290 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH13P55290 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH13P55290 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH13P55290 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH13P55290 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH13P55290 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH13P55290 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH13P55290 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH13P55290 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH13P55290 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH13P55290 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH13P55290 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH13P55290 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH13P55290 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH13P55290 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH13P55290 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH13P55290 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH13P55290 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH13P55290 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH13P55290 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH13P55290 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH13P55290 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH13P55290 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH13P55290 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms