Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMP1P54849 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMP1P54849 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP1P54849 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP1P54849 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP1P54849 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP1P54849 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP1P54849 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP1P54849 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP1P54849 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP1P54849 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP1P54849 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP1P54849 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP1P54849 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP1P54849 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP1P54849 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP1P54849 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP1P54849 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP1P54849 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP1P54849 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP1P54849 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP1P54849 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP1P54849 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMP1P54849 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMP1P54849 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMP1P54849 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMP1P54849 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EMP1P54849 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMP1P54849 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EMP1P54849 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EMP1P54849 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms