Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D1P54289 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D1P54289 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms