Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNB3P54284 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB3P54284 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms