Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNS1AP54105 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms