Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFIP1P53367 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFIP1P53367 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP1P53367 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms