Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF140P52738 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF140P52738 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms