Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDR1P51861 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDR1P51861 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDR1P51861 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDR1P51861 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDR1P51861 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDR1P51861 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDR1P51861 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDR1P51861 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDR1P51861 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDR1P51861 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDR1P51861 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDR1P51861 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDR1P51861 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDR1P51861 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR1P51861 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR1P51861 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR1P51861 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR1P51861 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR1P51861 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR1P51861 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR1P51861 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR1P51861 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDR1P51861 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDR1P51861 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR1P51861 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR1P51861 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR1P51861 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR1P51861 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR1P51861 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR1P51861 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR1P51861 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR1P51861 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR1P51861 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR1P51861 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR1P51861 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR1P51861 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR1P51861 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR1P51861 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR1P51861 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR1P51861 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR1P51861 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR1P51861 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR1P51861 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR1P51861 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR1P51861 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR1P51861 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDR1P51861 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDR1P51861 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDR1P51861 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDR1P51861 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR1P51861 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR1P51861 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR1P51861 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR1P51861 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR1P51861 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR1P51861 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR1P51861 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR1P51861 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR1P51861 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR1P51861 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR1P51861 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR1P51861 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR1P51861 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR1P51861 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR1P51861 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR1P51861 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR1P51861 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR1P51861 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR1P51861 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR1P51861 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR1P51861 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR1P51861 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR1P51861 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR1P51861 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR1P51861 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR1P51861 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDR1P51861 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDR1P51861 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDR1P51861 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDR1P51861 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDR1P51861 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDR1P51861 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDR1P51861 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDR1P51861 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDR1P51861 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR1P51861 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR1P51861 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR1P51861 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR1P51861 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR1P51861 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR1P51861 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR1P51861 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDR1P51861 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDR1P51861 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDR1P51861 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDR1P51861 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDR1P51861 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDR1P51861 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDR1P51861 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms